有机联系原则：档案之间存在着各种内在的有机联系，包括时间联系、内容联系、来源联系等。在整理档案时，要充分考虑和保持这些联系。比如，按照年度顺序整理档案，可以体现档案形成的时间脉络；将同一问题、同一项目或同一事件相关的档案集中在一起，则体现了内容上的联系。通过保持档案的有机联系，能够更好地展现档案所反映的历史事实和活动过程，提案的利用价值。
按来源分类
组织机构分类法：按照档案形成的组织机构进行分类，将同一部门或单位形成的档案集中在一起。如政府机关中，不同科室形成的档案分别归类，能体现各部门的职能和工作范围，以及部门之间的协作关系。
作者分类法：以档案的作者为分类依据，将同一作者形成的档案归为一类。对于个人档案或一些特定作者群体的档案，这种分类方法有助于了解作者的思想、工作风格和学术成就等。
分析档案内容
浏览：对档案进行的浏览和初步分析，了解每份档案的大致内容、涉及的主要事项、关键人物、时间等要素，为确定主题和分类标准提供基础信息。
提取关键信息：从档案内容中提取关键的词汇、短语或概念，这些关键信息往往能够反映档案的核心主题。例如，在一份关于企业市场营销活动的档案中，“市场推广”“产品宣传”“客户调研” 等可能是关键信息，可据此确定与市场营销相关的主题。
考虑档案形成背景和目的
了解形成主体：明确档案是由哪个组织、部门或个人形成的，以及其主要职能和业务范围。不同的形成主体会有不同的工作重点和主题倾向，这有助于确定档案的主题和分类标准。例如，学校的档案可能会围绕教学、科研、学生管理等主题分类，而企业的档案则会侧重于生产、销售、财务等方面。
分析形成目的：思考档案形成的目的是什么，是为了记录工作过程、总结经验教训、提供决策依据，还是为了其他特定的用途。档案的形成目的往往与主题密切相关，例如，为了总结项目经验而形成的档案，可能会以项目名称或类型作为主题分类的依据。